与常规口岸不同，为更高效承担全岛绝大部分往内地的货运物流，海口将新海港和南港的货运查验任务功能前置，集中建设海口新海港和南港“二线口岸”（货运）集中查验场所建设项目及海南综合型寄递物流监管中心建设项目（以下简称“二线口岸查验所项目”），项目通过“物流+监管”双核驱动，集约化布局20万+平方米查验场地，高效完成对货运及寄递物流的查验及监管服务。

设计深度回应热带海岛气候特征，将遮阴避雨功能与在地文化转译融合：首层延续海口骑楼街廊的空间风格，通过连续拱廊形成光影交织的物流通道；二层轻盈的膜结构顶棚以海口市花三角梅形态为原型，纯白曲面既遮蔽烈日暴雨，又以海浪般的柔美曲线重塑口岸建筑表情。